学校法人同志社の八田英二理事長は10月30日の記者会見で、同志社と日本基督教団に組織的なつながりはないとの立場を繰り返した。辺野古沖の転覆事故で高校生ら2人が死亡したことを受け、教団の考え方や教育内容が事故につながったとの指摘も否定。同志社大のゼミ生が過去に抗議船へ乗船したことは認めた。産経新聞が報じた。