인천시금고 선정 과정에서 특혜 논란이 불거졌다. 시민단체는 공정성 문제를 제기하며 금융기관의 지역사회 기여도를 비판했다. 특히, 시금고 공모 전 하나금융그룹과 인천시가 체결한 금융지원 협약이 선정에 영향을 미칠 수 있다는 의혹이 제기되었다. 이에 대한 시민단체의 정면 비판이 이어지고 있다.