文部科学省は、辺野古沖での修学旅行中の船転覆事故に関し、学校法人に安全管理の不備と教育基本法違反を認定し是正を指導した。この認定は、教育現場の政治的中立性や教育内容に影響を与える可能性があり、教育関係者からは戸惑いの声も上がっている。過去の教科書検定での事例も引き合いに出され、今後の教育への影響が懸念されている。