6·3 지방선거 당일 전국 91개 투표소에서 7천194매의 투표용지가 부족해 투표가 장시간 중단되는 사태가 발생했다. 특히 서울 지역 투표소에서 혼란이 집중되었으며, 최장 105분간 투표가 중단된 곳도 있었다. 중앙선거관리위원회의 부실한 선거 관리와 투표율 예측 실패가 원인으로 지목된다.